mavis package

Subpackages

• mavis.annotate package
  • Submodules
    • base module
    • constants module
    • file_io module
    • genomic module
    • main module
    • protein module
    • splicing module
    • variant module
  • Module contents
    • Sub-package Documentation
      • Types of Output Files
      • Algorithm Overview
      • Levels of Annotations
      • Overview of Class Relationships
• mavis.bam package
  • Submodules
    • cache module
    • cigar module
    • read module
    • stats module
  • Module contents
• mavis.cluster package
  • Submodules
    • cluster module
    • constants module
    • main module
  • Module contents
    • Sub-package Documentation
      • Types of Output Files
      • Algorithm Overview
• mavis.illustrate package
  • Submodules
    • constants module
    • diagram module
    • elements module
    • scatter module
    • util module
  • Module contents
• mavis.pairing package
  • Submodules
    • constants module
    • main module
    • pairing module
  • Module contents
    • Sub-package Documentation
      • Output Files
      • Algorithm Overview
• mavis.summary package
  • Submodules
    • constants module
    • main module
    • summary module
  • Module contents
    • Sub-package Documentation
      • Output Files
      • Algorithm Overview
• mavis.validate package
  • Submodules
    • base module
    • call module
    • constants module
    • evidence module
    • main module
  • Module contents
    • Sub-package Documentation
      • Types of Output Files
      • Algorithm Overview

Submodules

• align module
• assemble module
• blat module
• breakpoint module
• config module
• constants module
• error module
• interval module
• main module
• tools module
• util module
• version module

Module contents

holds submodules related to structural variants